Sensibilidad de las pruebas de RT-PCR de muestras del tracto respiratorio superior para SARS-CoV-2 en pacientes hospitalizados.

La sensibilidad de una única prueba (test) es del 82,2% y aumenta al 90,6% con la segunda prueba.
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Objetivos: Determinar la sensibilidad y especificidad de las pruebas de RT-PCR de muestras del tracto respiratorio superior (URT) de pacientes hospitalizados con COVID-19, en comparación con el estándar de oro de un diagnóstico clínico.
Métodos: Se revisaron todas las pruebas de RT-PCR URT para SARS-CoV-2 en NHS Lothian, Escocia, Reino Unido, entre el 7 de febrero y el 19 de abril de 2020 (inclusive), y se identificaron pacientes hospitalizados. Se analizaron todas las pruebas URT RT-PCR para cada paciente para determinar la secuencia de resultados negativos y positivos. Para aquellos que fueron evaluados dos veces o más pero nunca recibieron un resultado positivo, se revisaron los registros de casos y se asignó un diagnóstico clínico de COVID-19 en función de las características clínicas, el diagnóstico del alta y los resultados de radiología y hematología. Para aquellos que tenían pruebas de RT-PCR URT negativas pero un diagnóstico clínico de COVID-19, las muestras respiratorias se volvieron a analizar utilizando un panel respiratorio multiplex, un segundo ensayo de RT-PCR SARS-CoV-2 y un control de RNasa P humana.
Resultados: en comparación con el estándar de oro de un diagnóstico clínico de COVID-19, la sensibilidad de una RT-PCR URT inicial para COVID-19 fue del 82,2% (intervalo de confianza del 95% 79,0-85,1%). Dos pruebas de RT-PCR URT consecutivas aumentaron la sensibilidad al 90,6% (IC 88,0-92,7%). Otro 2.2% y 0.9% de los pacientes que recibieron un diagnóstico clínico de COVID-19 fueron positivos en una tercera y cuarta prueba.
Conclusiones: la sensibilidad de una única prueba de RT-PCR de una muestra de URT en pacientes hospitalizados es del 82,2%. La sensibilidad aumenta al 90,6% cuando los pacientes se prueban dos veces. Una proporción de casos con COVID-19 clínicamente definido nunca da positivo en URT RT-PCR a pesar de las pruebas repetidas.